目前口腔潰瘍病因及致病機制仍不明，存在明顯的個體差異。有人提出復發(fā)性口腔潰瘍發(fā)病的遺傳、環(huán)境和免疫“三聯(lián)因素論”，即遺傳背景加上適當?shù)沫h(huán)境因素（包括精神神經(jīng)體質(zhì)、心理行為狀態(tài)、生活工作和社會環(huán)境等）引發(fā)異常的免疫反應面出現(xiàn)復發(fā)性口腔潰瘍特征性病損。也有人提出“二聯(lián)因素論”，即外源性感染因素（病毒和細菌）和內(nèi)源性誘導因素（激素的變化、精神心理因素、營養(yǎng)缺乏、系統(tǒng)性疾病及免疫功能紊亂）相互作用而致病。總之，學界的趨同看法是復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)生是多種因素綜合作用的結果。
1．免疫因素
細胞免疫異常：近年對復發(fā)性口腔潰瘍的病因研究多集中在免疫學方面，其中又以細胞免疫為主。患者存在細胞免疫功能的下降和T淋巴細胞亞群失衡。細胞免疫主要是指T淋巴細胞介導的免疫應答反應。大量對復發(fā)性口腔潰瘍患者T淋巴細胞亞群的分析、功能測定和淋巴因子研究顯示出細胞免疫現(xiàn)象，提示T淋巴細胞在復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)病中作用。
2．遺傳因素
對復發(fā)性口腔潰瘍的單基因遺傳、多基因遺傳、遺傳標記物和遺傳物質(zhì)的研究表明，復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)病有遺傳傾向。
3．系統(tǒng)性疾病因素
臨床實踐經(jīng)驗和流行病學調(diào)查均發(fā)現(xiàn)復發(fā)性口腔潰瘍與胃潰瘍、十二指腸潰瘍、潰瘍性結腸炎、局限性腸炎、肝膽疾病及由寄生蟲引起的各種消化道疾病或功能紊亂密切相關。研究指出消化道功能紊亂約占復發(fā)性口腔潰瘍發(fā)病誘因的30％。有人隨機對121名復發(fā)性口腔潰瘍患者進行臨床表現(xiàn)和胃鏡檢查，有70名確診患有消化系統(tǒng)疾病。另有一些報道RAU患者食管、胃和十二指腸存在與復發(fā)性口腔潰瘍相似的淺表性小潰瘍。
4．感染因素
有人從潰瘍表面培養(yǎng)出L型鏈球菌，用分子生物學技術檢出幽門螺桿菌且抗菌治療效果較好，還有人對283例復發(fā)性口腔潰瘍患者行結核菌素試驗，結果73．5％陽性，67？3％抗結核抗體陽性，提供了感染的證據(jù)。另外，有人從病損中分離出腺病毒、從患者循環(huán)免疫復合物中發(fā)現(xiàn)單純皰疹病毒（HSV）的DNA或從口腔脫落上皮細胞中檢測出人類巨細胞病毒（H（：MV）的DNA；也有研究報道發(fā)現(xiàn)，在急性期復發(fā)性口腔潰瘍患者的外周血單核細胞中，人類皰疹病毒6（HHV-6）、人類皰疹病毒7（HHV-7）、人類乳頭狀病毒（EBV）等病毒的DNA片段陽性率顯著高于正常人；然而大部分對病毒進行培養(yǎng)的研究都沒能從口腔潰瘍病損區(qū)直接分離到上述研究提及的HSV、HHV、EBV、HCMV等等病毒；而且有人認為，由于腺病毒在體內(nèi)廣泛分布，即使在復發(fā)性口腔潰瘍病損中檢測出陽性結果，其臨床意義也不大。因此盡管在復發(fā)性口腔潰瘍患者的病損部位發(fā)現(xiàn)了一些感染證據(jù)，但大多數(shù)學者認為，這些感染證據(jù)是病因還是繼發(fā)現(xiàn)象值得進一步探討，感染是否作為復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)病因素或復發(fā)性口腔潰瘍是否屬于感染性疾病目前仍有爭議。
5．環(huán)境因素
隨著“生物-心理-社會”醫(yī)學模式的轉化，對復發(fā)性口腔潰瘍患者的心理環(huán)境、生活工作環(huán)境和社會環(huán)境等等的研究引起重視。如人格問卷調(diào)查結果表明，復發(fā)性口腔潰瘍患者的A型行為類型得分高于正常人，回顧發(fā)病1年內(nèi)多數(shù)人有明顯的重要生活事件存在，說明復發(fā)性口腔潰瘍與緊張刺激的心理反應密切相關。有人發(fā)現(xiàn)學生的復發(fā)性口腔潰瘍復發(fā)率在考試前明顯上升；經(jīng)常更換工作崗位的人在工作環(huán)境變化時期容易復發(fā)性口腔潰瘍；男性口腔潰瘍的臨床癥狀得到改善，此外，研究表明，維生素B1、B2、B6、B12及葉酸等攝人不足，或血清中缺鋅、缺鐵、高銅等均與復發(fā)性口腔潰瘍發(fā)生有一定的相關性。有報道稱戒煙亦可誘發(fā)復發(fā)性口腔潰瘍。牙膏中的成分l2一烷硫酸鈉（sodium lauryl sulphate）可能刺激黏膜，誘發(fā)口腔潰瘍。說明生活節(jié)奏和生活習慣、工作、氣候、食物、營養(yǎng)等等生活工作環(huán)境和社會環(huán)境均與復發(fā)性口腔潰瘍的發(fā)生有一定的關系。
6．其他因素
事實上有關復發(fā)性口腔潰瘍發(fā)病因素的研究范圍遠遠不止于上述5個方面。大量的臨床實踐和動物實驗證實，尚有許多其他因素值得探討。
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