一是免疫功能的異常：
免疫系統(tǒng)是人體最重要、最堅(jiān)實(shí)的抵抗各種內(nèi)外環(huán)境致病因子的屏障武器。如果人體免疫功能出現(xiàn)各種異常，則必然會影響到其抵抗消滅入侵人體的各種致病因子的能力，但大量的臨床研究顯示，乙肝患者90%以上都不同程度的存在著免疫功能的異常和紊亂。
二是病毒復(fù)制繁殖的特殊位置：
研究顯示，乙肝病毒將其復(fù)制和繁殖病毒的大營設(shè)在肝細(xì)胞核內(nèi)，同時(shí)不斷攝取并利用肝細(xì)胞的核酸物質(zhì)來合成自身的生命遺傳物質(zhì)，這不但對肝細(xì)胞本身產(chǎn)生了不同程度的損傷，同時(shí)也給藥物的治療帶來了巨大困難。
三是抗病毒藥物的局限性：
現(xiàn)代抗病毒藥物都不能直接到達(dá)肝細(xì)胞核，這樣，抗病毒藥物只能守候在肝細(xì)胞核外等待已經(jīng)復(fù)制好的病毒出來才能予以清除和殲滅。由于藥物無法直接進(jìn)入細(xì)胞核，所以存在于肝細(xì)胞核里的病毒很難徹底被清除，這也是為什么目前各種抗病毒治療都幾乎無法轉(zhuǎn)陰的根本原因。
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